Etablissement public créé par la loi, le CNFPT est doté d'instances politiques nationales et régionales composées à égalité de représentants des collectivités employeurs et de représentants de leurs personnels.
Ces instances déterminent les priorités nationales et régionales en matière de formation, d'emploi et de carrière, ainsi que leur mode de réalisation, en tenant compte des besoins exprimés par les collectivités.
Au total, quelque 1 800 élus et représentants des agents participent activement à la vie et à l'évolution du CNFPT, au sein du conseil d'administration, du conseil national d'orientation ou des 28 conseils régionaux d'orientation.
— 28 délégations régionales,
— 4 écoles nationales d'application (ENACT),
— un institut national des études territoriales (INET).
Les délégations régionales sont chargées de relayer et d'assurer la mise en oeuvre des politiques nationales en matière de formation, d'emploi et de carrière. Elles veillent également aux réalités des territoires et à prendre en compte les besoins des collectivités territoriales.
Elles assurent des missions liées à la formation, à l'organisation de concours déconcentrés et à l'emploi territorial.